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RSS generated by JIRA (8.3.4#803005-sha1:1f96e09b3c60279a408a2ae47be3c745f571388b) at Sat Feb 10 15:29:01 JST 2024

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    <title>PFS-JIRA</title>
    <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira</link>
    <description>This file is an XML representation of an issue</description>
    <language>en-us</language>    <build-info>
        <version>8.3.4</version>
        <build-number>803005</build-number>
        <build-date>13-09-2019</build-date>
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<item>
            <title>[REDMINE1D-70] [RM-5811] invalid values @ -1</title>
                <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira/browse/REDMINE1D-70</link>
                <project id="11002" key="REDMINE1D">1D Redmine </project>
                    <description>&lt;p&gt;&lt;em&gt;&lt;font color=&quot;#505f79&quot;&gt; Created on 2020-06-04 10:27:07 by Didier Vibert. % Done: 100&lt;/font&gt;&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;


&lt;p&gt;logFluxHa et la plupart des valeurs en sortie sont initialis&#233;es &#224; -1 et conservent cette valeur si non utilis&#233;e.&lt;br/&gt;
pour logFLuxHa -1 est une valeur aberrante mais possible en fonction des unit&#233;s.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Il faudrait d&#233;finir des valeurs pour les diff&#233;rents cas suivants: &lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;unused (eg amplitude du continu si pas de continu fitt&#233;)&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;not measurable (eg Ha pas dans la couverture)&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;error (eg log(0.) si le flux est mesur&#233; &#224; zero)&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;p&gt;Il faudrait discuter, peut-&#234;tre au cas/cas de la pertinence de distinguer ces cas. Si pas de distinction, NaN pourrait &#234;tre une solution&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Une fois impl&#233;ment&#233;, il en d&#233;coulera une t&#226;che pour adapter vizu.&lt;/p&gt;</description>
                <environment></environment>
        <key id="16774">REDMINE1D-70</key>
            <summary>[RM-5811] invalid values @ -1</summary>
                <type id="3" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/secure/viewavatar?size=xsmall&amp;avatarId=10518&amp;avatarType=issuetype">Task</type>
                                            <priority id="10000" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/priorities/medium.svg">Normal</priority>
                        <status id="10002" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/statuses/generic.png" description="The issue is resolved, reviewed, and merged">Done</status>
                    <statusCategory id="3" key="done" colorName="green"/>
                                    <resolution id="10000">Done</resolution>
                                        <assignee username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</assignee>
                                    <reporter username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</reporter>
                        <labels>
                    </labels>
                <created>Fri, 4 Jun 2021 01:21:44 +0000</created>
                <updated>Wed, 5 Jul 2023 07:47:50 +0000</updated>
                            <resolved>Wed, 5 Jul 2023 07:47:49 +0000</resolved>
                                                                        <due></due>
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                                                                <comments>
                            <comment id="33734" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:36 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2020-06-04 10:32:26:&lt;br/&gt;
Didier VIBERT wrote:&lt;br/&gt;
&amp;gt; logFluxHa et la plupart des valeurs en sortie sont initialis&#233;es &#224; -1 et conservent cette valeur si non utilis&#233;e.&lt;br/&gt;
&amp;gt; pour logFLuxHa -1 est une valeur aberrante mais possible en fonction des unit&#233;s.&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; Il faudrait d&#233;finir des valeurs pour les diff&#233;rents cas suivants: &lt;br/&gt;
&amp;gt; * unused (eg amplitude du continu si pas de continu fitt&#233;)&lt;br/&gt;
c-a-d si la mesure du flux a &#233;chou&#233;? je sugg&#232;re flux =10^-100 (ou -1000 si c&apos;est num&#233;riquement possible)&lt;br/&gt;
&amp;gt; * not measurable (eg Ha pas dans la couverture)&lt;br/&gt;
NaN&lt;br/&gt;
&amp;gt; * error (eg log(0.) si le flux est mesur&#233; &#224; zero)&lt;br/&gt;
si le flux mesur&#233; est &amp;lt;1sigma, on fixe flux=10^-90&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; Il faudrait discuter, peut-&#234;tre au cas/cas de la pertinence de distinguer ces cas. Si pas de distinction, NaN pourrait &#234;tre une solution&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; Une fois impl&#233;ment&#233;, il en d&#233;coulera une t&#226;che pour adapter vizu.&lt;/p&gt;
</comment>
                            <comment id="33735" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:39 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2021-02-05 10:42:51:&lt;br/&gt;
also linked to &lt;a href=&quot;https://projets.lam.fr/issues/6304&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://projets.lam.fr/issues/6304&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="33736" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:39 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2021-02-10 08:55:20:&lt;br/&gt;
Vincent LE BRUN wrote in #note-2:&lt;br/&gt;
&amp;gt; Didier VIBERT wrote:&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; logFluxHa et la plupart des valeurs en sortie sont initialis&#233;es &#224; -1 et conservent cette valeur si non utilis&#233;e.&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; pour logFLuxHa -1 est une valeur aberrante mais possible en fonction des unit&#233;s.&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; Il faudrait d&#233;finir des valeurs pour les diff&#233;rents cas suivants: &lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; * unused (eg amplitude du continu si pas de continu fitt&#233;)&lt;br/&gt;
&amp;gt; c-a-d si la mesure du flux a &#233;chou&#233;? je sugg&#232;re flux =10^-100 (ou -1000 si c&apos;est num&#233;riquement possible)&lt;br/&gt;
j&apos;avais pas compris le cas, plut&#244;t NaN&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; * not measurable (eg Ha pas dans la couverture)&lt;br/&gt;
&amp;gt; NaN&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; * error (eg log(0.) si le flux est mesur&#233; &#224; zero)&lt;br/&gt;
&amp;gt; si le flux mesur&#233; est &amp;lt;1sigma, on fixe flux=10^-99.9&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; Il faudrait discuter, peut-&#234;tre au cas/cas de la pertinence de distinguer ces cas. Si pas de distinction, NaN pourrait &#234;tre une solution&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; Une fois impl&#233;ment&#233;, il en d&#233;coulera une t&#226;che pour adapter vizu.&lt;/p&gt;
</comment>
                            <comment id="33737" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:40 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2021-02-10 20:26:54:&lt;br/&gt;
pour r&#233;sumer, je propose donc ceci:&lt;/p&gt;

&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;unused (eg amplitude du continu si pas de continu fitt&#233;) : @NAN@&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;not measurable (eg Ha pas dans la couverture) : @NAN@&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;error (eg log(0.) si le flux est mesur&#233; &#224; zero) : &#224; d&#233;terminer au cas/cas.&lt;br/&gt;
 Pour le cas log(0), je propose @-INF@ qui existe en flottant IEEE , plut&#244;t que -90/-1000, etc...(sachant qu&apos;on a bien les r&#233;sultats suivant en calcul flottant IEEE754: @log(0)=-INF@ et @exp(-INF)=0@)&lt;br/&gt;
Pour les autres cas d&apos;erreur il faudrait qu&apos;il soit pris en charge par la gestion d&apos;erreur, ie qu&apos;un retour permette de savoir qu&apos;il y a eu une erreur, ce qui permet de distinguer les cas NAN attendus sans erreurs des cas avec erreurs.&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;p&gt;&#224; v&#233;rifier avec Ali que c&apos;est bon pour vizu/api python/hdf5&lt;/p&gt;

</comment>
                            <comment id="33738" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:41 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2021-02-16 09:04:27:&lt;br/&gt;
c&apos;est OK pour moi&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="33739" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:41 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Mira Sarkis on 2022-01-27 11:32:04:&lt;br/&gt;
&lt;a href=&quot;https://gitlab.lam.fr/CPF/cpf-redshift/-/merge_requests/258&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://gitlab.lam.fr/CPF/cpf-redshift/-/merge_requests/258&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Mr pour amazed-output-analyze: &lt;a href=&quot;https://gitlab.lam.fr/amazed/amazed-output-analyzer/-/merge_requests/7&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://gitlab.lam.fr/amazed/amazed-output-analyzer/-/merge_requests/7&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="33740" author="r2j.migrate" created="Wed, 5 Jul 2023 07:47:42 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Pierre-yves Chabaud on 2022-02-07 19:02:05:&lt;br/&gt;
Merged into @develop@ : @e49a562@&lt;/p&gt;</comment>
                    </comments>
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