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RSS generated by JIRA (8.3.4#803005-sha1:1f96e09b3c60279a408a2ae47be3c745f571388b) at Sat Feb 10 15:28:54 JST 2024

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    <title>PFS-JIRA</title>
    <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira</link>
    <description>This file is an XML representation of an issue</description>
    <language>en-us</language>    <build-info>
        <version>8.3.4</version>
        <build-number>803005</build-number>
        <build-date>13-09-2019</build-date>
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<item>
            <title>[REDMINE1D-60] [RM-5973] use inverse variance instead of variance</title>
                <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira/browse/REDMINE1D-60</link>
                <project id="11002" key="REDMINE1D">1D Redmine </project>
                    <description>&lt;p&gt;&lt;em&gt;&lt;font color=&quot;#505f79&quot;&gt; Created on 2020-09-17 15:50:28 by Didier Vibert. % Done: 0&lt;/font&gt;&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;


&lt;p&gt;&#224; l&apos;int&#233;rieur de la libraire, changer le vecteur d&apos;erreur (dans la classe FluxAxis) &lt;/p&gt;

&lt;p&gt;pour contenir l&apos;inverse de la variance au lieu de sqrt(variance)&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;int&#233;r&#234;t: &lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;ne pas accepter de variance nulle (c&apos;est d&#233;j&#224; test&#233; dans la m&#233;thode validnoise)&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;pouvoir traiter des variances infinies (ie inv variance nulle) et donc des samples flagg&#233; autrement qu&apos;en les supprimant du spectre au niveau du client.&lt;br/&gt;
c&apos;est une n&#233;cessit&#233; dans le cas du log-lambda (Fourrier), il faut conserver tous les samples r&#233;guli&#232;rement espac&#233;s en log&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;p&gt;(&#224; regarder s&apos;il vaut  mieux prendre la racine carr&#233;e ou non...)&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;note: le vecteur d &apos;erreur est actuellement inclu en &quot;perruque&quot; &#224; l&apos;int&#233;rieur du FluxAxis, peut &#234;tre int&#233;ressant d&#8217;&#233;crire une classe sp&#233;cifique (d&#233;riv&#233;e de FluxAxis ou FluxAxis itself ?) aggrg&#233;e dans CSpectrum. ticket refactor sp&#233;cifique ?&lt;/p&gt;</description>
                <environment></environment>
        <key id="16764">REDMINE1D-60</key>
            <summary>[RM-5973] use inverse variance instead of variance</summary>
                <type id="3" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/secure/viewavatar?size=xsmall&amp;avatarId=10518&amp;avatarType=issuetype">Task</type>
                                            <priority id="10000" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/priorities/medium.svg">Normal</priority>
                        <status id="10100" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/statuses/generic.png" description="No further work should be done on this.">Won&apos;t Fix</status>
                    <statusCategory id="3" key="done" colorName="green"/>
                                    <resolution id="2">Won&apos;t Fix</resolution>
                                        <assignee username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</assignee>
                                    <reporter username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</reporter>
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                <created>Fri, 4 Jun 2021 01:21:15 +0000</created>
                <updated>Mon, 18 Sep 2023 18:53:53 +0000</updated>
                            <resolved>Mon, 18 Sep 2023 18:53:53 +0000</resolved>
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                                                                <comments>
                            <comment id="35055" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:53:26 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Pierre-yves Chabaud on 2020-09-17 15:59:50:&lt;br/&gt;
Didier VIBERT wrote:&lt;br/&gt;
&amp;gt; note: le vecteur d &apos;erreur est actuellement inclu en &quot;perruque&quot; &#224; l&apos;int&#233;rieur du FluxAxis, peut &#234;tre int&#233;ressant d&#8217;&#233;crire une classe sp&#233;cifique (d&#233;riv&#233;e de FluxAxis ou FluxAxis itself ?) aggrg&#233;e dans CSpectrum. ticket refactor sp&#233;cifique ?&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Je ne connais pas les raisons historiques (ou de conception) qui ont amen&#233; l&apos;erreur a se retrouver dans la classe FluxAxis. Cela dit, peut-on imaginer une classe mere FluxAxis et des classes filles FluxAxisErr, FluxAxisVar, FluxAxisInvVar... qui permettraient de s&apos;affranchir de la &quot;nature&quot; de l&apos;erreur ?&lt;/p&gt;
</comment>
                            <comment id="35056" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:53:32 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2020-09-17 16:54:36:&lt;br/&gt;
Pierre-yves CHABAUD wrote in #note-1:&lt;br/&gt;
&amp;gt; Didier VIBERT wrote:&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; note: le vecteur d &apos;erreur est actuellement inclu en &quot;perruque&quot; &#224; l&apos;int&#233;rieur du FluxAxis, peut &#234;tre int&#233;ressant d&#8217;&#233;crire une classe sp&#233;cifique (d&#233;riv&#233;e de FluxAxis ou FluxAxis itself ?) aggrg&#233;e dans CSpectrum. ticket refactor sp&#233;cifique ?&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; Je ne connais pas les raisons historiques (ou de conception) qui ont amen&#233; l&apos;erreur a se retrouver dans la classe FluxAxis. Cela dit, peut-on imaginer une classe mere FluxAxis et des classes filles FluxAxisErr, FluxAxisVar, FluxAxisInvVar... qui permettraient de s&apos;affranchir de la &quot;nature&quot; de l&apos;erreur ?&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;sur le plan de la structure des objets, &#231;a me parait bien. Apr&#232;s le but d&apos;avoir InvVar c&apos;est de pouvoir y mettre 0 si le sample doit &#234;tre masqu&#233;. Sinon il faut utliser l&apos;IEEE inf. On peut imaginer que le client ait acc&#232;s &#224; ces diff&#233;rentes classes possible et qu&apos;on sache convertir vers l&apos;InvVar pour l&apos;utiliser en interne, du coup le mieux est peut &#234;tre d&apos;avoir une classe FluxInvVar avec diff&#233;rents constructeurs qui puissent convertir directement en InvVar ? &lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35057" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:53:39 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Pierre-yves Chabaud on 2020-09-17 17:03:36:&lt;br/&gt;
Didier VIBERT wrote in #note-2:&lt;br/&gt;
&amp;gt; sur le plan de la structure des objets, &#231;a me parait bien. Apr&#232;s le but d&apos;avoir InvVar c&apos;est de pouvoir y mettre 0 si le sample doit &#234;tre masqu&#233;. Sinon il faut utliser l&apos;IEEE inf. On peut imaginer que le client ait acc&#232;s &#224; ces diff&#233;rentes classes possible et qu&apos;on sache convertir vers l&apos;InvVar pour l&apos;utiliser en interne, du coup le mieux est peut &#234;tre d&apos;avoir une classe FluxInvVar avec diff&#233;rents constructeurs qui puissent convertir directement en InvVar ?&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Oui, ca me semble une bonne id&#233;e. On fonctionne en interne avec de l&apos;inverse variance et l&apos;API permet l&apos;exploitation d&apos;erreur/variance de diff&#233;rentes &quot;natures&quot; en faisant la conversion.&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35058" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:53:45 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2023-08-29 16:08:01:&lt;br/&gt;
toujours int&#233;ressant ?&lt;/p&gt;</comment>
                    </comments>
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