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RSS generated by JIRA (8.3.4#803005-sha1:1f96e09b3c60279a408a2ae47be3c745f571388b) at Sat Feb 10 15:31:31 JST 2024

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    <title>PFS-JIRA</title>
    <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira</link>
    <description>This file is an XML representation of an issue</description>
    <language>en-us</language>    <build-info>
        <version>8.3.4</version>
        <build-number>803005</build-number>
        <build-date>13-09-2019</build-date>
    </build-info>


<item>
            <title>[REDMINE1D-319] [RM-8312] [multiobs][linemodel] Adapt AbstractFitter::fitAmplitude</title>
                <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira/browse/REDMINE1D-319</link>
                <project id="11002" key="REDMINE1D">1D Redmine </project>
                    <description>&lt;p&gt;&lt;em&gt;&lt;font color=&quot;#505f79&quot;&gt; Created on 2023-09-21 08:07:40 by Ali Allaoui. % Done: 100&lt;/font&gt;&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;


&lt;p&gt;Review CLineModelElement::m_OutsideLambdaRange and CLineModelElement::m_LineIsActiveOnSupport definition (maybe move them to CLineModelElementList) : CLineModelElement::prepareSupport&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;CLineModelElementList should be a vector of CLlineModelElement not shared_ptr&amp;lt;CLlineModelElement&amp;gt;&lt;/p&gt;</description>
                <environment></environment>
        <key id="24015">REDMINE1D-319</key>
            <summary>[RM-8312] [multiobs][linemodel] Adapt AbstractFitter::fitAmplitude</summary>
                <type id="3" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/secure/viewavatar?size=xsmall&amp;avatarId=10518&amp;avatarType=issuetype">Task</type>
                                            <priority id="10000" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/priorities/medium.svg">Normal</priority>
                        <status id="10002" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/statuses/generic.png" description="The issue is resolved, reviewed, and merged">Done</status>
                    <statusCategory id="3" key="done" colorName="green"/>
                                    <resolution id="10000">Done</resolution>
                                        <assignee username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</assignee>
                                    <reporter username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</reporter>
                        <labels>
                    </labels>
                <created>Thu, 21 Sep 2023 18:16:28 +0000</created>
                <updated>Tue, 6 Feb 2024 18:40:02 +0000</updated>
                            <resolved>Tue, 6 Feb 2024 18:40:02 +0000</resolved>
                                                                        <due></due>
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                                                                <comments>
                            <comment id="37080" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:01 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2023-09-29 13:31:01:&lt;br/&gt;
&lt;a href=&quot;https://gitlab.lam.fr/CPF/cpf-redshift/-/merge_requests/553&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://gitlab.lam.fr/CPF/cpf-redshift/-/merge_requests/553&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37081" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:07 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2023-10-02 12:50:21:&lt;br/&gt;
&lt;a href=&quot;https://gitlab.lam.fr/amazed/dataset-parameters/-/merge_requests/60&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://gitlab.lam.fr/amazed/dataset-parameters/-/merge_requests/60&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37082" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:13 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 08:49:50:&lt;br/&gt;
un truc &#224; v&#233;rifier aussi: dans @TLineModelResult::updateFromModel@ il y a des calculs qui sont faits via des appels &#224; &lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;@CLineModelFitting::getCumulSNRStrongEL()@&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;@CLineModelFitting::getLinesAboveSNR()@&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;@CLineModelFitting::getElementList().GetModelNonZeroElementsNDdl()@&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;@CLineModelFitting::getOutsideLinesSTD(...)@&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;p&gt;or toutes ces m&#233;thodes font un calcul sur un model ou spectre, donc une observation seulement. Il faut donc modifier ces m&#233;thodes pour mutualiser (accumuler) le r&#233;sultat sur toutes les obs&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37083" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:28 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2023-10-17 08:58:53:&lt;br/&gt;
oui j&apos;avais rep&#233;r&#233; d&#233;j&#224;, GetModelNonZeroElementsNDdl c&apos;est fait&lt;br/&gt;
getLinesAboveSNR je pensais le laisser dans SpectrumModel et donc utiliser le snr calcul&#233; sur l&apos;observation et non sur toutes les observations, pour ensuite aggr&#233;ger toutes les lines above snr&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37084" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:37 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 10:04:15:&lt;br/&gt;
Ali Allaoui wrote in #note-5:&lt;br/&gt;
&amp;gt; oui j&apos;avais rep&#233;r&#233; d&#233;j&#224;, GetModelNonZeroElementsNDdl c&apos;est fait&lt;br/&gt;
ok&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&amp;gt; getLinesAboveSNR je pensais le laisser dans SpectrumModel et donc utiliser le snr calcul&#233; sur l&apos;observation et non sur toutes les observations, pour ensuite aggr&#233;ger toutes les lines above snr&lt;br/&gt;
c&apos;est pas forc&#233;ment le mieux, lorsque une raie est visible sur plusieurs obs &#224; la fois, si les obs se chevauchent., dans ce cas l&#224; il faut calculer le SNR sur la totalit&#233; des pixels pour lequel la raie est visible, car les SNR utilis&#233;s sont des SNR &quot;direct integration&quot; et non pas des SNR param&#233;triques: fitted_amplitude / sqrt(var(fitted_amplitude))&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37085" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:45 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2023-10-17 10:11:24:&lt;br/&gt;
Didier Vibert wrote in #note-6:&lt;br/&gt;
&amp;gt; Ali Allaoui wrote in #note-5:&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; oui j&apos;avais rep&#233;r&#233; d&#233;j&#224;, GetModelNonZeroElementsNDdl c&apos;est fait&lt;br/&gt;
&amp;gt; ok&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; getLinesAboveSNR je pensais le laisser dans SpectrumModel et donc utiliser le snr calcul&#233; sur l&apos;observation et non sur toutes les observations, pour ensuite aggr&#233;ger toutes les lines above snr&lt;br/&gt;
&amp;gt; c&apos;est pas forc&#233;ment le mieux, lorsque une raie est visible sur plusieurs obs &#224; la fois, si les obs se chevauchent., dans ce cas l&#224; il faut calculer le SNR sur la totalit&#233; des pixels pour lequel la raie est visible, car les SNR utilis&#233;s sont des SNR &quot;direct integration&quot; et non pas des SNR param&#233;triques: fitted_amplitude / sqrt(var(fitted_amplitude))&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Ok donc d&#233;placer getLinesAboveSNR dans CLineModelFitting, je verrais si je gagne &#224; conserver des bouts dans CSpectrumModel&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37086" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:51 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2023-11-15 08:54:17:&lt;br/&gt;
Plus de bug en mono obs, une revue peut &#234;tre int&#233;ressante pendant que je track les bugs multiobs.&lt;br/&gt;
Il y a aussi une issue dataset-parameters qui modifie se8_multiobs pour le rendre comparable &#224; se8&lt;br/&gt;
&lt;a href=&quot;https://gitlab.lam.fr/amazed/dataset-parameters/-/merge_requests/60&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://gitlab.lam.fr/amazed/dataset-parameters/-/merge_requests/60&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="37087" author="r2j.migrate" created="Tue, 6 Feb 2024 18:39:56 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Pierre-yves Chabaud on 2024-01-17 16:38:42:&lt;br/&gt;
Merged into @develop@ (@0210a55e@)&lt;/p&gt;</comment>
                    </comments>
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