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RSS generated by JIRA (8.3.4#803005-sha1:1f96e09b3c60279a408a2ae47be3c745f571388b) at Sat Feb 10 15:31:19 JST 2024

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    <title>PFS-JIRA</title>
    <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira</link>
    <description>This file is an XML representation of an issue</description>
    <language>en-us</language>    <build-info>
        <version>8.3.4</version>
        <build-number>803005</build-number>
        <build-date>13-09-2019</build-date>
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<item>
            <title>[REDMINE1D-298] [RM-8259] SNR n&#233;gatif under lines</title>
                <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira/browse/REDMINE1D-298</link>
                <project id="11002" key="REDMINE1D">1D Redmine </project>
                    <description>&lt;p&gt;&lt;em&gt;&lt;font color=&quot;#505f79&quot;&gt; Created on 2023-09-06 12:35:46 by Vincent Le Brun. % Done: 100&lt;/font&gt;&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;


&lt;p&gt;dans l&apos;&#233;chantillon /net/CESAM/amazed/validation_tests/release_0.44/output_pfc_0.44-RC5 dans un des objets class&#233; quasar ( 00232106 ) le param&#232;tre StrongEmissionLinesSNR est n&#233;gatif (ce qui ne devrait pas pouvoir exister), je ne sais pas si c&apos;est un probl&#232;me librairie ou vizu. &lt;/p&gt;

&lt;p&gt;MR: &lt;a href=&quot;https://gitlab.lam.fr/CPF/cpf-redshift/-/merge_requests/559&quot; class=&quot;external-link&quot; rel=&quot;nofollow&quot;&gt;https://gitlab.lam.fr/CPF/cpf-redshift/-/merge_requests/559&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</description>
                <environment></environment>
        <key id="23833">REDMINE1D-298</key>
            <summary>[RM-8259] SNR n&#233;gatif under lines</summary>
                <type id="3" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/secure/viewavatar?size=xsmall&amp;avatarId=10518&amp;avatarType=issuetype">Task</type>
                                            <priority id="10000" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/priorities/medium.svg">Normal</priority>
                        <status id="10002" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/statuses/generic.png" description="The issue is resolved, reviewed, and merged">Done</status>
                    <statusCategory id="3" key="done" colorName="green"/>
                                    <resolution id="10000">Done</resolution>
                                        <assignee username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</assignee>
                                    <reporter username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</reporter>
                        <labels>
                    </labels>
                <created>Wed, 6 Sep 2023 18:15:16 +0000</created>
                <updated>Mon, 6 Nov 2023 18:29:32 +0000</updated>
                            <resolved>Mon, 6 Nov 2023 18:29:32 +0000</resolved>
                                                                        <due></due>
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                            <comment id="35705" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:27:31 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 08:26:49:&lt;br/&gt;
a fix to add: the  @StrongEmissionLinesSNR@ is duplicated by the output (in same HDF5 dataset ie candidate/model_parameters) @StrongELSNR@. The latter should be removed from result_specification.csv&lt;/p&gt;
</comment>
                            <comment id="35706" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:27:43 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 09:56:24:&lt;br/&gt;
pour info: cette quantit&#233; @StrongEmissionLinesSNR@ est une somme de SNR des raies en &#233;mission avec un SNR &amp;gt; 8 (hrad-cod&#233;) ou dont le SNR est &amp;gt; 80% de la somme de tous les SNR des raies en &#233;mission. Le SNR de chaque raie &#233;tant calcul&#233; comme: Flux int&#233;gr&#233; du spectre moins le continu / sqrt(somme des pixels variance). &lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Je trouve &#231;a assez bizarre de faire des sommes de SNR, &#231;a n&apos;a pas de sens &#224; mon avis...&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;si on tient &#224; conserver ce type d&apos;info, je propose de calculer non pas la somme des SNR, mais le SNR de la somme des raies, c-a-d somme_des_flux / sqrt(somme_des_pixels_variance), en conservant &#224; peu pr&#232;s la m&#234;me s&#233;lection des raies: SNR individuel &amp;gt; 8, ou SNR individuel  &amp;gt; 80% du SNR total (de toutes les raies en &#233;mission visibles)&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;@vlebrun, &#231;a te va ?&lt;br/&gt;
on peut aussi virer tout &#231;a !&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35707" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:27:54 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2023-10-17 10:01:33:&lt;br/&gt;
clairement la somme des SNR n&apos;a aucun sens, et &#231;a aurait un sens de garder le SNR calcul&#233; sur les raies strong du linecatalog (ce qui &#233;viterait d&apos;avoir un crit&#232;re sur le SNR de chaque raie qui a une origine assez trouble pour moi)&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35708" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:28:04 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 10:13:32:&lt;br/&gt;
Vincent Le Brun wrote in #note-7:&lt;br/&gt;
&amp;gt; clairement la somme des SNR n&apos;a aucun sens, et &#231;a aurait un sens de garder le SNR calcul&#233; sur les raies strong du linecatalog (ce qui &#233;viterait d&apos;avoir un crit&#232;re sur le SNR de chaque raie qui a une origine assez trouble pour moi)&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;ok du coup je propose 2 sorties: &lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;StrongEmissionLinesSNR: SNR calcul&#233; sur les raies strong du linecatalog&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;EmissionLinesSNR: SNR calcul&#233; sur toutes les raies en &#233;mission du linecatalog&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;p&gt;&#231;a peut &#234;tre utile, si on trouve des solutions avec un SNR total plus for que le SNR strong... &lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35709" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:28:14 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2023-10-17 10:14:25:&lt;br/&gt;
en effet, c&apos;est bon pour moi&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35710" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:28:26 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 10:17:13:&lt;br/&gt;
@aallaoui &#231;a va sans doute conflicter un peu avec ton issue #8312&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35711" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:28:37 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 10:35:42:&lt;br/&gt;
 &quot;StrongEmissionLinesSNR&quot; ,  strict ou  pas ?&lt;br/&gt;
dans le code actuel, pour chaque SNR individuel on agr&#232;ge les raies qui se chevauchent, et par exemple pour Euclid, on comptera NII dans le SNR Ha.&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35712" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:28:47 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2023-10-17 10:36:59:&lt;br/&gt;
vu que c&apos;est rien d&apos;officiel, on va au plus simple, si les raies se chevauchent &#231;a n&apos;aurait pas forc&#233;ment de sens de s&#233;parer..&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35713" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:29:00 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Ali Allaoui on 2023-10-17 12:18:43:&lt;br/&gt;
Didier Vibert wrote in #note-10:&lt;br/&gt;
&amp;gt; @aallaoui &#231;a va sans doute conflicter un peu avec ton issue #8312&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;c&apos;est urgent ? parce que je peux aussi modifier l&#233;g&#232;rement 8312 pour ne rien casser au monoobs et la valider maintenant&lt;br/&gt;
J&apos;allais justement commencer cette partie, @dvibert tu peux v&#233;rifier que 8312 en l&apos;&#233;tat ne conflicte pas trop avec cette issue ? et si on ne merge pas que je travaille sur des &#233;l&#233;ments qui ne conflictent pas&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35714" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:29:11 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2023-10-17 13:17:32:&lt;br/&gt;
Ali Allaoui wrote in #note-13:&lt;br/&gt;
&amp;gt; Didier Vibert wrote in #note-10:&lt;br/&gt;
&amp;gt; &amp;gt; @aallaoui &#231;a va sans doute conflicter un peu avec ton issue #8312&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; c&apos;est urgent ? parce que je peux aussi modifier l&#233;g&#232;rement 8312 pour ne rien casser au monoobs et la valider maintenant&lt;br/&gt;
&amp;gt; J&apos;allais justement commencer cette partie, @dvibert tu peux v&#233;rifier que 8312 en l&apos;&#233;tat ne conflicte pas trop avec cette issue ? et si on ne merge pas que je travaille sur des &#233;l&#233;ments qui ne conflictent pas&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;rien de tr&#232;s urgent... je la passerai apr&#232;s toi, et donc je g&#232;rerai les conflits, si tu ne tardes pas trop sur #8312. h&#233;h&#233;... t&apos;as pas un peu la pression l&#224; ?  &#128512;&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35715" author="r2j.migrate" created="Mon, 6 Nov 2023 18:29:18 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Pierre-yves Chabaud on 2023-10-27 12:22:33:&lt;br/&gt;
Merged into @develop@ (@05b54892@)&lt;/p&gt;</comment>
                    </comments>
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