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RSS generated by JIRA (8.3.4#803005-sha1:1f96e09b3c60279a408a2ae47be3c745f571388b) at Sat Feb 10 15:30:35 JST 2024

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    <title>PFS-JIRA</title>
    <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira</link>
    <description>This file is an XML representation of an issue</description>
    <language>en-us</language>    <build-info>
        <version>8.3.4</version>
        <build-number>803005</build-number>
        <build-date>13-09-2019</build-date>
    </build-info>


<item>
            <title>[REDMINE1D-227] [RM-6176] Classification S/G - Vipers</title>
                <link>https://pfspipe.ipmu.jp/jira/browse/REDMINE1D-227</link>
                <project id="11002" key="REDMINE1D">1D Redmine </project>
                    <description>&lt;p&gt;&lt;em&gt;&lt;font color=&quot;#505f79&quot;&gt; Created on 2020-12-08 10:01:11 by Mira Sarkis. % Done: 100&lt;/font&gt;&lt;/em&gt;&lt;/p&gt;


&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;Faire un nouveau run
	&lt;ul&gt;
		&lt;li&gt;avec Zstars = &lt;span class=&quot;error&quot;&gt;&amp;#91;-3E-3; 3E3&amp;#93;&lt;/span&gt; (hardcoded)&lt;/li&gt;
		&lt;li&gt;sur des donn&#233;es vipers qui sont de bonne qualit&#233; et plus r&#233;aliste, qui contiennent un m&#233;lange d&apos;&#233;toiles et de galaxies.&lt;/li&gt;
		&lt;li&gt;peut-etre sur des donn&#233;es SC8 si on les r&#233;coit en Janvier?&lt;/li&gt;
	&lt;/ul&gt;
	&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;Produire une matrice de confusion:
	&lt;ul&gt;
		&lt;li&gt;pour les stars pris pour des galaxies, regarder les valeurs des redshifts trouv&#233;s (Zgalaxie)&lt;/li&gt;
	&lt;/ul&gt;
	&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;Envoyer un fichier r&#233;cap. des r&#233;sultats de ces runs
	&lt;ul&gt;
		&lt;li&gt;se mettre d&apos;accord avec Mathieu sur le format et les colonnes de ce document&lt;/li&gt;
	&lt;/ul&gt;
	&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;

</description>
                <environment></environment>
        <key id="23640">REDMINE1D-227</key>
            <summary>[RM-6176] Classification S/G - Vipers</summary>
                <type id="3" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/secure/viewavatar?size=xsmall&amp;avatarId=10518&amp;avatarType=issuetype">Task</type>
                                            <priority id="10000" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/priorities/medium.svg">Normal</priority>
                        <status id="10002" iconUrl="https://pfspipe.ipmu.jp/jira/images/icons/statuses/generic.png" description="The issue is resolved, reviewed, and merged">Done</status>
                    <statusCategory id="3" key="done" colorName="green"/>
                                    <resolution id="10000">Done</resolution>
                                        <assignee username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</assignee>
                                    <reporter username="r2j.migrate">Redmine-Jira Migtation</reporter>
                        <labels>
                    </labels>
                <created>Wed, 5 Jul 2023 06:39:36 +0000</created>
                <updated>Mon, 18 Sep 2023 18:51:14 +0000</updated>
                            <resolved>Tue, 5 Sep 2023 18:26:27 +0000</resolved>
                                                                        <due></due>
                            <votes>0</votes>
                                    <watches>1</watches>
                                                                <comments>
                            <comment id="35045" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:09 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Mira Sarkis on 2021-02-03 09:23:21:&lt;br/&gt;
Premiers r&#233;sultats du run sur les donn&#233;es Vipers (pas de donn&#233;es SC8 convenables):&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;R&#233;pertoire de sortie: /net/CESAM/nas10c/scratch/msarkis/vipers/output_6246_2Feb_GSClassification&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;R&#233;sultats obtenus pour 58974 spectres.&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;Matrice de confusion normalis&#233;e (Total: 1057 &#233;toiles et 57917 galaxies):
&lt;div class=&apos;table-wrap&apos;&gt;
&lt;table class=&apos;confluenceTable&apos;&gt;&lt;tbody&gt;
&lt;tr&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt; Normalized&lt;/td&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;Stars&lt;/td&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;Galaxy&lt;/td&gt;
&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;Star_Label&lt;/td&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;0.559&lt;/td&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;0.025&lt;/td&gt;
&lt;/tr&gt;
&lt;tr&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;Galaxy_Label&lt;/td&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;0.441&lt;/td&gt;
&lt;td class=&apos;confluenceTd&apos;&gt;0.975&lt;/td&gt;
&lt;/tr&gt;
&lt;/tbody&gt;&lt;/table&gt;
&lt;/div&gt;
&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;Pour les stars pris pour des galaxies, en pi&#232;ces-jointes des plots sur les valeurs des redshifts trouv&#233;s (Zgalaxie).&lt;br/&gt;
Les Zgalaxies prennent des valeurs de 10-2 &#224; 4.9999&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;

</comment>
                            <comment id="35046" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:14 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Mira Sarkis on 2021-02-03 09:35:19:&lt;br/&gt;
Je joins aussi: &lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;le fichier de sortie redshift.csv et&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;la liste des spectres des vraies &#233;toiles (extraite &#224; partir de /net/GECO/users/vlebrun/VIPERS-W1/aspic_vipers_dr2_w1_catalog.txt )&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
</comment>
                            <comment id="35047" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:20 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2021-02-03 11:09:51:&lt;br/&gt;
OK donc on est bon pour reconnaitre les galaxies, c&apos;est plut&#244;t bien...&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Pour les &#233;toiles, il faudrait donner la r&#233;partition en fonction du flag de confiance (z_flag) parce que si on ne se trompe que pour les spectres pourris c&apos;est pas grave...&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35048" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:29 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Didier Vibert on 2021-02-03 11:30:31:&lt;br/&gt;
Vincent LE BRUN wrote in #note-5:&lt;br/&gt;
&amp;gt; OK donc on est bon pour reconnaitre les galaxies, c&apos;est plut&#244;t bien...&lt;br/&gt;
&amp;gt; &lt;br/&gt;
&amp;gt; Pour les &#233;toiles, il faudrait donner la r&#233;partition en fonction du flag de confiance (z_flag) parce que si on ne se trompe que pour les spectres pourris c&apos;est pas grave...&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&#224; regarder aussi avec les &#233;vidences ou proba respectives...&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35049" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:35 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Mira Sarkis on 2021-02-03 15:31:43:&lt;br/&gt;
Pour les &lt;b&gt;&quot;mis-classified stars&quot;&lt;/b&gt; :&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
	&lt;li&gt;Je vous joins un plot de leurs zflags:
	&lt;ul&gt;
		&lt;li&gt;&lt;b&gt;zflags allant de 1.2 &#224; 4.2&lt;/b&gt;&lt;/li&gt;
	&lt;/ul&gt;
	&lt;/li&gt;
	&lt;li&gt;Pour les probaG/S: (c&apos;&#233;tait la gal&#232;re pour r&#233;cup&#233;rer les r&#233;sultats de la classification depuis hdf5. Il faut surement ajouter ces donn&#233;es au redshift.csv final)
	&lt;ul&gt;
		&lt;li&gt;je vous joins un plot des proba des galaxies et proba des stars. &lt;b&gt;98.5% des spectres&lt;/b&gt; de &quot;mis-classified stars&quot; ont &lt;b&gt;une probaGalaxy&amp;gt;=0.8&lt;/b&gt; .&lt;/li&gt;
	&lt;/ul&gt;
	&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;


&lt;p&gt;Pour info: jupyter notebook i&#231;i: /net/CESAM/amazed/msarkis/vipers/starClassificationAnalysis.ipynb&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35050" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:44 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Matthieu Bethermin on 2021-02-05 09:49:17:&lt;br/&gt;
Merci Mira.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;Je viens de regarder de mon c&#244;t&#233;. On fait un bon boulot pour ne pas perdre de galaxies et celles qu&apos;on perd ont tendance &#224; avoir un merit bas. Par contre pour les &#233;toiles c&apos;est vraiment 50-50 et il n&apos;a a rien de franc en terme de merit. Par conter, ces &#233;toiles finissent en grande majorit&#233; &#224; bas z ou autour de z=3 (je suis moins s&#251;r de comprendre). Donc, elles ne vont pas perturber l&apos;&#233;chantillon spectro Euclid qui est entre 0.9 et 1.8.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;J&apos;ai demand&#233; &#224; Vincent les true redshift des galaxies pour savoir lesquels finissent par erreur en &#233;toiles. Si c&apos;est que du bas z, &#231;a ne sera pas un probl&#232;me. Je posterai le notebook quand j&apos;aurais fini cette partie.&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35051" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:49 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2021-02-05 16:11:53:&lt;br/&gt;
z=3 correspond au break lyman (ou lyman alpha) confondu avec le break &#224; 4000 des &#233;toiles ...&lt;br/&gt;
faut voir aussi si &#231;a correspond &#224; un type donn&#233;e d&apos;&#233;toiles dont on aurait pas le template&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35052" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:48:57 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Matthieu Bethermin on 2021-02-05 16:49:56:&lt;br/&gt;
Bon, je confirme que les quelques galaxies mal classifi&#233;es sont surtout &#224; bas z et ce n&apos;est pas pilot&#233; par le distribution en z de VIPERS. J&apos;ai attach&#233; le notebook o&#249; j&apos;ai fait quelques plots.&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35053" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:49:04 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2021-12-14 14:04:45:&lt;br/&gt;
en attente de la correction du ticket #6875 (gestion de la LSF) et du #6503 (evidence star/galaxies)&lt;/p&gt;</comment>
                            <comment id="35054" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:49:09 +0000"  >&lt;p&gt;Comment by Vincent Le Brun on 2023-09-05 14:40:29:&lt;br/&gt;
vu la qualit&#233; des spectres (ou plus exactement de celle du spectre de bruit) je pense qu&apos;il ne faut pas trop en demander &#224; la classification. &lt;/p&gt;</comment>
                    </comments>
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                            <attachment id="16507" name="GSprobas_missedStars2.png" size="18966" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:50:54 +0000"/>
                            <attachment id="16505" name="redshift.csv" size="9225075" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:50:05 +0000"/>
                            <attachment id="16504" name="starsRef.csv" size="16467" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:49:47 +0000"/>
                            <attachment id="16506" name="zflag_missedStars.png" size="18230" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:50:37 +0000"/>
                            <attachment id="16502" name="zgalaxies_starsAsGalaxies_vipers.png" size="24684" author="r2j.migrate" created="Mon, 18 Sep 2023 18:49:18 +0000"/>
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